Virüsleri temizleme yöntemleri çok farklı şekilde olmaktadır. Bunlar genel olarak şu şekilde sıralanabilir;

• Yardımcı programlar kullanmak,
• Antivirüs programları kullanmak,
• Formatlama yapmak (Taşbaşı, Abdurrahman ve Altınbaşak, Orhan 1991).

Virüs olduğunu tespit ettikten sonra bundan kurtulmanın en iyi yolu; bilgisayarı virüssüz bir sistem disketiyle açmak ve SYS komutuyla sistem kütüklerinin (IO.SYS VE DOS.SYS) yeniden yüklenmesi ve COMMAND.COM kütüğünün kopyalanması yöntemidir. Virüs bulaştığı belirlenen program yine de çalıştırılmak isteniyorsa çalıştırıldıktan sonra makinanın kapatılıp tekrar açılması bellekte bulunan virüsün diğer programlara bulaşmasını önlemektedir (Karakaya, Mevlüt ve diğerleri 1993).

Virüsler hakkında bazı önemli notlar:

1. Virüs kendiliğinden oluşmaz bir programcı tarafından yazılması gerekir.
2. İyi niyetli virüsler de vardır.
3. Virüslü bir disket veya program makinada çalıştırılmadığı sürece bulaşmaz.
4. Disketten bilgi okunması virüs bulaştırmaz.
5. Protect (koruma) yuvası kapalı olan diskete virüs bulaşma imkanı daha azdır.
6. Virüsler, Veri (Data) dosyalarına bulaşamaz (Karakaya, Mevlüt ve diğerleri 1993).